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Auteur Maud Salmona |
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Ajouter le résultat dans votre panier Affiner la recherche Interroger des sources externesAspects virologiques, diagnostic et variants du SARS-CoV-2 / Marion Helary in La revue du praticien, Vol. 72, n°5 (mai 2022)
Titre : Aspects virologiques, diagnostic et variants du SARS-CoV-2 : un virus au génome d’une grande plasticité Type de document : texte imprimé Auteurs : Marion Helary ; Maud Salmona ; Eve-Marie Walle ; [et al.] Année de publication : 2022 Article en page(s) : p. 494-500 Note générale : Fait partie du dossier "Infection par le SARS-COV-2 Langues : Français (fre) Catégories : [MeSH] Techniques analytiques, diagnostiques, thérapeutiques et équipements:Diagnostic
[MeSH] Virologie
[RAMEAU] SARS-CoV-2 (virus)Mots-clés : variants Résumé : Le SARS-CoV-2 est un virus enveloppé à ARN monocaténaire linéaire non segmenté de polarité positive. L’enveloppe porte la protéine Spike (S) qui reconnaît le récepteur ACE2 sur la cellule cible et permet l’entrée du virus. Les nombreuses mutations sur la protéine S sont à l’origine d’une grande diversité génétique, impliquées dans le franchissement de la barrière d’espèce et l’échappement aux anticorps neutralisants. Le mode de transmission principal est respiratoire. Le virus réplique dès vingt-quatre heures après l’infection, et l’ARN viral est détecté par les techniques de diagnostic direct ; la technique de référence est la RT-PCR sur prélèvement nasopharyngé. Pour élargir le dépistage, la RT-PCR sur prélèvement salivaire et les tests antigéniques ont été développés. La majorité des patients développent des anticorps spécifiques en dix à quinze jours, qui sont détectables par les méthodes sérologiques ; il est recommandé de combiner la recherche des anticorps anti-N (nucléocapside) et anti-S. Le génome viral est doté d’une grande plasticité, et des variants ont émergé dès l’été 2020. Il en existe plusieurs classifications dont celle de l’Organisation mondiale de la santé qui attribue à chaque variant une lettre grecque. Enfin, Santé publique France a déployé un système de surveillance épidémiologique de ces variants à l’aide de techniques de criblage et de séquençage. Cycle : Généralités Permalink : http://www.galileonet.be/pmb/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=124473
in La revue du praticien > Vol. 72, n°5 (mai 2022) . - p. 494-500[article]
Titre : Intérêts de la métagénomique clinique en infectiologie Type de document : texte imprimé Auteurs : Victor Euzen ; Théo Ghelfenstein-Ferreira ; Jérôme Le Goff ; Maud Salmona Année de publication : 2024 Article en page(s) : p. 63-68 Langues : Français (fre) Catégories : [MeSH] Métagénomique
[MeSH] MicrobiologieRésumé : La métagénomique clinique (MgC) est un nouvel outil de biologie moléculaire dans l’arsenal diagnostique des microbiologistes. Elle permet de détecter sans a priori tous les micro-organismes présents. Utilisable sur tous types de prélèvements, elle nécessite plusieurs étapes (extraction, préparation des banques, séquençage par next generation sequencing, analyses bio-informatiques). Son utilisation en diagnostic a été décrite dans différentes pathologies (infections du système nerveux central, infections respiratoires, digestives, oculaires, cutanées et en cas de sepsis). En une seule analyse, la MgC permet également d’étudier le microbiome présent dans le prélèvement, d’analyser les transcrits microbiens et d’étudier la réponse de l’hôte. Sa place dans l’algorithme diagnostique doit faire l’objet d’études supplémentaires. En sus du diagnostic, la MgC a démontré son utilité dans la recherche de résistance aux traitements antimicrobiens, mais également en épidémiologie. Malgré les progrès visant à réduire les coûts, la MgC reste encore à l’heure actuelle plus coûteuse que les méthodes conventionnelles. La mise sur le marché de séquenceurs plus accessibles ainsi que le développement de tests commerciaux permettront l’utilisation de la MgC dans un plus grand nombre de laboratoires dans les années futures. Cycle : Généralités Permalink : http://www.galileonet.be/pmb/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=132116
in La revue du praticien > Vol. 74, n°1 (janvier 2024) . - p. 63-68[article]Exemplaires (1)
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité PSI001670 P24001PRA Périodique SI Galiléo Périodiques Disponible
